แม้ว่ามาตรวัดน้ำแบบกลไกมีข้อดีหลายประการ แต่ก็มีข้อจำกัดบางประการเช่นกัน:
1. ความแม่นยำที่จำกัด: ความแม่นยำของมาตรวัดน้ำแบบกลไกขึ้นอยู่กับอัตราการไหลของน้ำและความแม่นยำของส่วนประกอบทางกล เมื่ออัตราการไหลของน้ำต่ำ ความแม่นยำของมาตรวัดน้ำแบบกลไกจะลดลง
2. ต้องอ่านด้วยตนเอง: มาตรวัดน้ำแบบกลไกจำเป็นต้องอ่านด้วยตนเองซึ่งต้องใช้เวลาและความพยายาม
3. ไม่มีการจัดการแบบอัตโนมัติ: เนื่องจากมาตรวัดน้ำแบบกลไกไม่สามารถอ่านได้โดยอัตโนมัติ จึงไม่สามารถจัดการแบบอัตโนมัติได้ การอ่านค่ามิเตอร์จะต้องถูกบันทึกด้วยตนเองเพื่อวัตถุประสงค์ในการจัดการ